Ученые из Самарского государственного технического университета (СамГТУ) достигли значительного прогресса в изучении хеликазы коронавируса, создав компьютерную модель этого белка и направив свои усилия на поиск способов его воздействия на молекулярном уровне. Согласно их мнению, это открытие может послужить отправной точкой для разработки эффективного препарата для лечения COVID-19. Результаты исследования были опубликованы в журнале Current Computer-Aided Drug Design.
Хеликазы представляют собой класс ферментов, присутствующих во всех живых организмах. Их основная функция заключается в разделении двух цепей молекулы ДНК или внутримолекулярных связей в РНК, и именно эти ферменты способствуют распространению коронавируса в организме через его репликацию, пишет РИА новости.
Ученые из Самарского политеха обратились к компьютерному моделированию для поиска ингибиторов хеликазы, т.е. веществ, способных селективно подавлять ее активность. Доцент кафедры органической химии этого университета Вадим Ширяев объяснил, что жизненно важной характеристикой жизненного цикла SARS-CoV-2 является воспроизводство генетического материала вируса. Хеликаза играет важную роль в этом процессе, поскольку расплетает РНК вируса и позволяет другим белкам репликации скопировать ее. Согласно его словам, понимание механизма работы этого белка на микроуровне может значительно облегчить поиск потенциальных эффективных лекарственных препаратов для борьбы с COVID-19.
Ученый также заметил, что в настоящее время единственным подтвержденно эффективным «оружием» против коронавирусов являются вакцины, некоторые из них имеют чрезвычайно длинный список противопоказаний и нежелательных эффектов. Согласно его оценкам, вопрос об эффективности существующих химиопрепаратов для лечения уже заболевших пациентов остается спорным.
Виртуальная модель белка-хеликазы, созданная учеными, представляет собой упрощенную версию самого белка, но она помогает изучить поведение хеликазы от свободного состояния к связыванию с малой молекулой-ингибитором. По словам исследователей, такие модели позволяют использовать компьютерные расчеты для прогнозирования взаимодействия комплексов белок-лиганд на молекулярном уровне. Заведующий кафедрой органической химии Самарского политеха Юрий Климочкин отметил, что их исследование показало, что полость изучаемого белка может связываться с соединениями, имеющими каркасный фрагмент, напоминающий структуру алмаза. Такие соединения уже применяются для лечения различных заболеваний и могут являться отправной точкой для разработки новых препаратов для борьбы с коронавирусами.
Ученые считают, что предложенный подход подходит для создания молекул, взаимодействующих с другими вирусными хеликазами. Следующей задачей научной группы стало продолжение поиска ингибиторов репликации SARS-CoV-2. Исследование было поддержано грантом РНФ 21-73-20103.
При цитировании информации активная гиперссылка на neprosto.fun обязательна
